什么是 ITS 測序？ITS1 與 ITS2 選哪個好？

ITS 測序含義：ITS 是 internal transcribed spacer 的縮寫，內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)。

真核生物 rRNA 順反子作為一個轉(zhuǎn)錄單元，包含 18S、5.8S 和 28S rRNA。轉(zhuǎn)錄后的剪接加工過程，會移除兩個內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)和 5.8SrRNA ，這兩個內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)和 5.8SrRNA 統(tǒng)稱為 ITS 區(qū)。通常 18S rRN是作為真核生物分子鑒定的標(biāo)準(zhǔn)，但是 ITS 區(qū)在真菌分類里更加準(zhǔn)確，要優(yōu)于使用 18SrRNA作為標(biāo)準(zhǔn)得到的結(jié)果。

ITS1 和 ITS2 作為非編碼區(qū)，承受的選擇壓力較小，相對變化較大，并且能夠提供詳盡的系統(tǒng)學(xué)分析所需要的可遺傳性狀。最近的研究發(fā)現(xiàn)，ITS1 比 ITS2 效率更高、引物適用性更普遍和廣泛，此外 ITS1 的擴(kuò)增片段更短、GC 含量更低，因此 ITS1 可能更優(yōu)于 ITS2。