大多數(shù)二倍體基因組組裝都忽略了同源染色體之間的差異,將基因組組裝成一個假的單倍體序列,這是二倍體類型的組裝的人為共識。這種人為共識可能導(dǎo)致基因注釋的不準(zhǔn)確和生物學(xué)解釋的錯誤。
隨著研究的深入,發(fā)現(xiàn)僅單套的基因組數(shù)據(jù)難以完全演示該物種的全面信息。同源染色體之間不同遺傳位點(diǎn)的組合對生物表型有重要影響,如動植物中的雜種優(yōu)勢、某些物種雜交不育現(xiàn)象等。單倍型等位基因間差異對基因表達(dá)、功能及其表型都有著重要影響,大多數(shù)雜交品種的優(yōu)勢表型都受等位基因調(diào)控。
通過單倍型的分析,可為解析物種重要性狀形成的遺傳機(jī)制奠定重要基礎(chǔ)。單倍型在群體遺傳學(xué)上可分析等位基因間差異,追蹤個體親緣關(guān)系,了解生物遷徙模式和進(jìn)化歷史;在農(nóng)業(yè)上發(fā)掘優(yōu)異等位基因變異,探索雜種優(yōu)勢理論等。
可以對組裝的單倍型基因組的基因特征比較
檢測單倍型基因組間的結(jié)構(gòu)變異
分析單倍型基因組上基因表達(dá)情況,結(jié)合物種組織部位、發(fā)育時期研究等位基因不平衡表達(dá)
分析結(jié)構(gòu)變異所在基因或者附件基因的表達(dá)情況
測序類型 |
完成周期 |
組裝指標(biāo) |
測序深度 |
文庫大小 |
無親本 | 3-6個月(組裝注釋) (視物種具體情況而定) | 單套ContigN50≥2Mb(視物種具體情況而定) | 單套基因組HiFi數(shù)據(jù)≥30x | HiFi:15-20kb |
有親本 | 雙親二代數(shù)據(jù)≥50x 單套基因組HiFi數(shù)據(jù)≥30x | 二代:350bp HiFi:15-20kb |
| 无码人妻精品一区二区二秋霞影院 | 波多野结衣福利三区 | 国产鲁鲁视频在线观看特色 | 国产无套一区二区三区网站 | 免费av在线播放 | 国产又黄又爽又刺激av一区二区 | 国产传媒免费观看AV | 亚洲无码中文字幕在线观看 | 337p粉嫩大胆噜噜噜亚瑟影院 | 69精品人妻一区二区三区蜜桃乛 | 日韩视频在线免费观看 | 小黄书在线观看www官网 | 国产人妻人伦精品日本 | 成人羞羞 国产免费动态 | 夏晴子福利视频在线免费 | 紧身裤蜜桃臀久久影院 | 黄色污污污网站在线观看 | 国产美女裸体无遮挡免费观看 | 国产裸体免费无遮挡 | 亚洲精品无码成人片久久-涡桑剁 | 国产精品三级片在线观看 | 男女插插爆操啊啊啊欧美日韩 | 法国少妇色情影片在线 | 把女人弄爽A片户外直播 | 麻豆精品国产传媒在线精品 | 91九色人妻大屁股 | 美女很黄很黄的免费网站 | 日本强伦轩人妻中文字幕 | 潮喷 合集 喷水 mp4 | 成人黄网站 免费入口 | 国产电影一区二区三区 | 日本一级婬片AAAAAA片麻代 | 日韩中文字幕电影在线观看 | 欧美人妻精品久久久久久 | 亚洲国产成人精品无码区2022 | 潘金莲做爰高潮A片 | 中文字幕aV无码一区二区三区 | 婷婷人人爽人人爽人人A片 www.国产精品.com | 奴色虐aV一区二区三区 | 日批视频在线免费观看 |