T2T基因組(Telomere-to-Telomere),即端粒至端粒的完整基因組組裝的簡稱,是更完整基因組的代表。T2T基因組主要是通過多種測序平臺、高深度測序,結合多種軟件方式來獲得具有端粒與著絲粒的的gap-free或gap-less的高質量基因組。端粒為真核生物染色體末端的一種特殊結構,由 DNA重復序列和特異結合蛋白組成的復合體。高等生物的著絲粒由數千個高度重復單元串聯(lián)形成。而這些重復區(qū)域高度復雜,是三代測序與組裝中的難點,也是T2T基因組重點攻克對象。T2T基因組的構建將進一步助力物種基因組中復雜區(qū)域的解析,尤其是早期難以被破解的“黑色領域”,可為物種的深度研究提供重要的基礎信息。
可以獲得高準確性、高連續(xù)性、高完整性的端粒到端粒的高質量基因組
可以克服著絲粒和高重復區(qū)域的組裝難題
可以克服著絲粒和高重復區(qū)域的組裝難題
探索染色體的起源, 馴化以及鑒定性別關鍵基因
測序類型 |
完成周期 |
組裝指標 |
測序深度 |
文庫大小 |
PacBio?HiFi | 3-6個月(組裝注釋)
(視物種具體情況而定) |
至少一條染色體達到T2T
(視物種具體情況而定) |
基因組≥60x | 15-20kb |
ONT?Ultra-long | 基因組≥40x | 50kb/100kb/150kb |
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