數(shù)據(jù)上傳SRA之：微生物多樣性

文章寫完了，但是數(shù)據(jù)還不會(huì)上傳，怎么辦？小編現(xiàn)在教你如何上傳微生物多樣性數(shù)據(jù)到SRA數(shù)據(jù)庫，包教包會(huì)哦~

在數(shù)據(jù)上傳之前我們需要先注冊(cè)一個(gè)NCBI的賬號(hào)，這個(gè)小編就不做說明了；
首先，登錄NCBI主頁面后點(diǎn)擊Submit進(jìn)入到數(shù)據(jù)上傳頁面，然后選擇SRA數(shù)據(jù)庫點(diǎn)擊GO按鈕后接著點(diǎn)擊New submission（操作界面見下圖）；

第二步：填寫提交人的個(gè)人信息和單位信息；

第三步：填寫B(tài)ioSample、BioProject和數(shù)據(jù)釋放時(shí)間（之前沒有創(chuàng)建BioSample、BioProject可以選擇NO）；

第四步：項(xiàng)目信息填寫，根據(jù)實(shí)際情況填寫（帶有*號(hào)的為必填，其它可以不填寫）；

第五步：樣本類型選擇；

第六步：樣本具體信息，需要我們下載表格填寫，表格中綠色的為必填，藍(lán)色的需要至少填一個(gè)，其它內(nèi)容可以選填或者不填寫，如果是生物學(xué)重復(fù)需要添加一列replicate,填寫完成后需要將信息粘貼到文本文件中（TXT格式），然后上傳到網(wǎng)站上；

第七步：第六步表格上傳完成后，需要接著上傳Metadata表格，主要填寫樣品建庫測序的信息和需要上傳的文件名，填寫完成后也是導(dǎo)入到文本文件中然后上傳；

第八步：重點(diǎn)來了，這一步是將我們的數(shù)據(jù)傳到NCBI的服務(wù)器上，需要下載安裝一個(gè)軟件Aspera（http://downloads.asperasoft.com/connect2/，windows下也可以安裝）。軟件安裝完成后有兩種上傳方法：（1）可以直接上傳，適用于數(shù)據(jù)量小、樣本量小的項(xiàng)目；

（2）上傳方法適用于數(shù)據(jù)量大、樣本量大的項(xiàng)目；

具體操作步驟：
打開Windows Dos操作窗口，進(jìn)入到Aspera軟件的安裝目錄下；輸入命令

數(shù)據(jù)上傳完后，點(diǎn)擊Select preload folder就可以看到我們上傳的文件（至少需要等10分鐘后才能看到），然后選擇我們上傳的文件即可完成數(shù)據(jù)上傳。

最后點(diǎn)擊下方的continue，進(jìn)入到最后Overview界面然后點(diǎn)擊提交即可。

微生物事業(yè)部 李漢洲丨文案
付志超 | 審核
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